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疏水性分析结果
由图可知在P8蛋白C端位置有一个典型的疏水区域。
Bioedit 分析结果
跨膜区域分析
膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,执行着重要的细胞生物学功能。蛋白质序列含有跨膜区,提示他可能作为膜受体起作用,也可能定位在膜上的锚定蛋白或离子通道蛋白。对膜蛋
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白的跨膜螺旋进行预测是生物信息学的重要应用。
对RGDV P8蛋白使用TMHMM的跨膜区域分析结果1
信号肽预测
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从分析结果可以看出,剪切位点分值24,信号肽分值为3,综合剪切位点的分值4 Coil 区分析
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卷曲螺旋主要是控制蛋白质寡聚化的元件,含有卷曲结构的蛋白质主要是一些转录因子 通过分析发现,在P8蛋白在三种不同的窗口下尽然没有非常高的置信值,说明没有卷曲重复序列和七肽重复区。
亚细胞定位
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1、通过分析可知最终预测的叶绿体转运肽,线粒体导肽,信号肽的其他类型的分值分别为0.178、0.066,0.148,0.660。信号的定位可能是他们中的最高值。 2、“Loc”表示上面分值所预测的可能定位,C表示定位于叶绿体,可能是cTP;M表示定位于线粒体,可能是mTP;S表示分泌通路,即分泌到细胞周质,可能是SP;_表示除前面三处外的其他位置。 3、“RC”是可靠性级别,分为五级。表示输出结果最高值与次高值之间的差异大小,具体五级如下:1. Diff>0.800;2. 0.800>diff>0.600;3.0.600>diff>0.400;4.0.400>diff>0.200;0.200>diff. 4.TPlen的预测剪切位点的序列长度。
有结果可知目的蛋白P8的分泌途径为_型,定位在其他细胞器,预测剪切位点序列为0个氨基酸。
结构域的分析及motif的搜索
常见的结构域的5种类型:全平行结构域、反平型结构域、α+β结构域、α/β结构域及其他结构域类型。
结构域是蛋白质的功能结构和进化单元,结构功能域分析对于蛋白质的结构的分类和预测由重要的作用。
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生物信息学课程设计实验报告—典型的生物信息学分析报告



