Q-PCR实验流程
1. 确定进行Q-PCR的引物能够将目的基因扩增出唯一的目的条带,并且分子量应该保持在
200bp左右;
2. 将之前反转录得到的cDNA样本按照需要进行稀释,然后每孔按照如下体系进行加样:
cDNA 2ul F-primer 0.75ul R-primer 0.75ul SYBR 12.5ul ddH2O 9ul ———————————
Total 25ul
反应需要设置内参组,处理组和非处理组共三组,其中各组详细内容解释如下:
内参组(actin) 处理组(B) 非处理组(A)
每个反应组需要进行3个重复(生物学重复),已确保数据的可靠性并且需要明确加样顺序,Q-PCR使用8联排进行反应,加样后需要盖上透明盖子;
3. 选用 Bio-Rad CFX Q-PCR仪进行实时定量PCR,选用程序可参考文献报道的程序;
4. 反应结束后考取实验结果,并将反应后样品保留,需要进行凝胶电泳确保反应结果为单
一条带并注意实验结果的Tm 值和Cycle数,以明确实验结果的真实性; 5. 实验数据由相关软件打开后导出为Excel2003格式进行处理,数据处理方案选取 方
案,其相关处理方法如下:
( ) 1) 计算内参组的平均值,即生物学重复的均值,
Every cDNA X Actin primer 处理(给以不同刺激) B cDNA X Every primer 非处理(给以不同刺激) A cDNA X Every primer ; ,
2) 用处理组和非处理组的Cq值分别减去对应的内参组均值,即
;
3) 计算减去内参值后的非处理组的均值,即 ( ) 4) 计算处理组与非处理组之差,即 ,同时需要计
算非处理组与非处理组之差,即 ;
5) 计算2的- 次幂,即 ( );
6) 运用Graph Pad进行数据图像绘制,即可得到直观的图像数据。 注意:
A. 尽量保证SYBR避光;
B. 尽量保证使用的Q-PCR 8联排的透明盖子的表面没有磨损,如有磨损可能会影响到仪器
的读数;
C. Cq的读数范围应当避免超过30,如超过30,我们可以判定该cDNA中无此基因的表达; D. Q-PCR之前务必需要进行常规PCR,确保设计的引物只能扩增出唯一正确的主带。 E.
QPCR实验操作



